广西北仑河口国家级自然保护区位于我国大陆海岸线最西南端的广西壮族自治区防城港市西南沿海地带，包括东起防城区江山乡白龙半岛，西至东兴市东兴镇罗浮江与北仑河汇集处的滩涂和部分海域，跨越防城区和东兴市的13个自然村，地理坐标为东经108°00′30″－108°16′30″，′北纬21°31′00″－21°37′30″，海岸线总长105公里，总面积119.27平方公里（其中核心区面积48.65平方公里，实验区面积70.62平方公里），此外，外围缓冲区为保护区海岸线高潮线以上1公里以内的陆地分水岭面积35平方公里。保护区于1985年建立县级红树林保护区，1990年晋升为省级海洋自然保护区，2000年4月经国务院批准晋升为国家级自然保护区，以红树林生态系为保护对象。2001年7月，加入中国人与生物圈（MAB）组织，2004年7月加入中国生物多样性保护基金会自然保护区委员会，2008年2月加入国际重要湿地。

    保护区南濒北部湾，西与越南交界（北仑河为中越两国界河），自西向东跨越北仑河口、万尾岛和珍珠湾（港湾），有河口海岸、开阔海岸和海域海岸等地貌类型，属南亚热带海洋性季风气候区。保护区内有红树植物14种（其中真红树9种、半红树5种），主要红树植物种类有白骨壤、桐花树、秋茄、木榄、红海榄、海漆、老鼠勒、榄李、卤蕨、水黄皮、黄槿、杨叶肖槿、海芒果、银叶树等。其他常见高等植物19种，大型底栖动物84种，鱼类27种，鸟类128种（属国家二级保护动物13种）。具有较高的生物多样性。保护区内的红树林有林面积12.60平方公里，主要的红树植物群落类型有白骨壤群落、桐花树群落、秋茄群落、木榄群落和老鼠勒群落等12种，其中老鼠勒群落分布面积较大为国内少见。

    保护区地理位置特殊，珍珠湾内生长着我国大陆海岸连片面积最大的红树林和木榄纯林，是典型的海湾红树林和罕见的平均海平面以下大面积的红树林，在我国大陆沿海红树林中具有不可替代的重要性。红树林内还有大量的海洋生物资源和鸟类资源，是候鸟迁飞的重要中继站。

    目前，我保护区正承担着UNEP/GEF/SCS“防城港国际红树林示范区”项目，该项目由中国、泰国、柬埔寨、印尼、马来西亚、菲律宾、越南7个国家共同发起，由联合国环境规划署（UNEP)组织实施、全球环境基金（GEF）提供赞助的“关于扭转南中国海和泰国湾环境退化趋势”（SCS）中的红树林示范项目，项目于2004年7月正式启动实施，2004年9月“防城港国际红树林示范区”项目的实施运作经验，GEF监测与评估处主任JarleHarstad先生给予高度评价，称为“防城港模式”，为我国红树林示范区建设提供一个对外交流与合作的平台。与此同时，北仑河口保护区还承担着北仑河口生态监控区监测工作和实施国家908项目中广西部分的“北仑河口生态敏感区”和“广西红树林示范区”两个子项目。