山谷寺（三祖寺）、山谷寺始建于梁武帝时，为高僧宝志禅师首创。相传：南朝梁时，白鹤道人、宝志和尚两人都想在此建道场，梁武帝命他两各施法宝识地，得者居之，道人放白鹤，和尚抛锡杖，鹤飞在前，将落地时被锡杖飞来声所惊，止于他处，锡杖卓立此地，宝志即在此建寺。大同二年（536年）武帝萧衍赐名为山谷寺。

    中国佛教禅宗二祖曾在此驻锡，禅宗第三代祖师僧璨禅师在此圆寂，肉身葬于寺后小丘上，后人又称为三祖寺。现今寺门上高悬当代著名书法家赵朴初题写的“山谷寺”匾额。

    寺院内觉寂塔俗称三祖塔，建于唐玄宗时，塔下藏三祖舍利百粒，代宗大历七年，赐号曰觉寂，塔高六丈，七层八面，结构精巧，壁雕佛像栩栩如生，北有石级可登，外旋中空，螺旋而上。每层有四门相对，两虚两实，虚实分设。游人登塔，常被虚实所迷。

    1981年9月，安徽省人民政府公布觉寂塔为省级重点保护文物。1983年4月，国务院批准三祖寺为全国汉族地区重点开放寺院。从1987年至1997年，三祖寺先后重建了千佛殿、大雄宝殿等殿宇及配套设施，修缮了藏经楼和觉寂塔，总建筑面积达7000平方米。

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