湿地生态系统是鱼类生存、繁衍之地。由于云南地理位置特殊，鱼类多样性的研究及保护状况不仅在国内具有重要地位，对下游地区或国家也影响极大。因此，应引起国内、外生物学界和保护组织的高度重视。云南鱼类多样性的特点是：种类丰富、特有类群多；区系成分复杂、物种类型多样；种群小、数量少。对云南鱼类物种生存构成威胁的外在因素包括：围湖造田和沼泽化造成的栖息环境破坏；引种产生的物种生存空间及食物的竞争；污染引起的生存环境质量下降；过度捕捞或有害的渔具渔法导致的种群减小和灭绝；森林覆盖率下降、水源枯竭对栖息地的影响；水电站或水利灌溉大坝等设施对水域环境的影响。为了保护湿地生态系统中的生物，应重视生物各大类群的研究，加强鱼类物种灭绝内在机制的研究，引进物种应按照严格的法律程序。