百眼井是千古之谜，有三个理由。一是得名之谜，蒙古族牧民称其为“众狗之井”，这是何意？这些井是一群狗刨挖出来的？还是为一大群狗饮水之用？二是如何开凿出之谜，百眼井星罗棋布，深的百十米，浅的十余米，井壁光滑，无凿戳的痕迹，也没下井的蹬阶，百且穿透一层又一层坚硬的沙岩，鬼斧神工，叹为观止，谁有如此神力？三是百眼井周边地区多为荒漠化草地，古时也没有先进的探测仪器，咋知在层层沙岩之下，会有如此甘泉？

    传说，当年成吉思汗在这里屯驻大军，每日携带众多的猎狗，在草原上围捕黄羊、狍子、狐狸。一日，狩猎的人们人困马乏，猎狗焦渴，草原上既无清泉也无井水，成吉思汗心急如火，命令兵器巨匠尧勒达日玛，以最快的速度找到水源地，钻出１０８眼水井，解了燃眉之急。从此，当地牧民就称这片水井为“敖楞瑙亥音其日嘎”。为了防止泥沙淤塞，井口处以石块垒起的高约一米左右的圆形护墙，依然保存完好，俯视井下，幽幽然深不见底。