巴尔喀什湖是一东西长南北窄的狭长形湖泊,是世界第四长湖，东西长约605公里,湖区海拔340米，平均水深6米，最深达26米。湖水面积随水位高低在15500至19000平方公里左右。湖泊中部有一半岛，半岛以北的湖峡(宽约3.5公里)，把湖面分成了东西两部分。西半部广而浅，宽27公里～74公里，水深不超过11米，有伊犁河、卡拉塔尔河、阿克苏河、阿亚克兹河等河注入，湖水淡而清。东半部窄且深，宽10千米～20公里，水深25米，盐度较高。两湖之间有一狭窄的水道相连。
