清朝乾隆中叶，清政府为加强对新疆的管治，采取“军政合一”的管理制度，1762年，设立清政府设立全国驻军中权限最大，地域最广的新疆最高军政长官“总统伊犁等处将军”，简称“伊犁将军”，统辖包括巴尔喀什湖以东、以南，额尔齐斯河上游，天山南北两路，直至帕米尔等地的军政事务，1763年，首任伊犁将军明瑞修建惠远城，包括伊犁将军府（今伊犁霍城县），惠远成了新疆政治、军事、经济、文化中心，伊犁将军府就成了新疆最高军政衙门。
新疆最高军政衙门
1871年沙俄侵占伊犁，惠远老城被毁，1882年通过《中俄伊犁条约》收复伊犁，但霍尔果斯河以西51万平方公里的土地被沙俄吞并，收复伊犁后，同年在惠远旧城以北15公里处仿造旧城修建新城，包括伊犁将军府也重新修建，1893年竣工，仍然叫做惠远（惠远新城），由于大片土地的割让，此时的惠远城已经紧邻中俄边境，不再适合成为新疆的军政中心，1884年新疆建省后，将省会设在了东边的迪化（乌鲁木齐市），因此，从1762年到1884年的100多年期间，伊犁将军府都是新疆最高决策领导机关，之后，惠远依然是军事重镇，伊犁将军府负责北疆军防，直到1912年革命党人在新疆起义成功。
伊犁将军府
清代的“伊犁将军府”，在今霍城县惠远镇惠远古城内东大街，坐北朝南，是一座园林式的古建筑群，四周是高大的围墙，当跨入威严的黑漆大门后，便见宽敞的庭院内，古榆参天，左右营房、东西厢房、正堂、四合院等建筑，黑柱飞檐，曲径回廊，古朴幽深，花园内树木葱隆，似江南名园，景致清幽。据记载：清代将军府内，驻将军一员，及其家眷、卫兵等，附设有营务、印房、粮晌、驼马、功过等处，专理各项事宜。
将军亭
古色古香
后花园的六角凉亭，称之为”将军亭“，红柱绿瓦，古色古香，遥想当年，似乎看到官员们议事、休闲的场景来。
